学院现有7个科研机构，分别为：
1、生态经济研究院（负责人：张利国）
2、中国农业农村现代化研究院（负责人：周应恒）；
3、江西财经大学制度与经济发展研究中心（负责人：王小平）；
4、监管与治理研究所（负责人：陈富良）；
5、江西财经大学资产评估研究中心（负责人：李国民）；
5、资本论与当代经济研究所（负责人：刘爱文）
6、江西财经大学社会经济史研究所（负责人：邱永志）
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